Szok!

Testy PCR na koronawirusa wykrywają ludzkie DNA?

Chodzi o sekwencję CTCCCTTTGTTGTGTTGT w RdRp

Niedawno pojawiła się kolejna teoria spiskowa – jakoby testy RT-PCR wykorzystywane w diagnostyce SARS-CoV-2 zawierały primery (startery) RdRP o sekwencji nukleotydowej CTCCCTTTGTTGTGTTGT, która występuje w ludzkim DNA na chromosomie 8. Czy to znaczy, że wyniki dodatnie faktycznie nie świadczą o zarażeniu, ale są spowodowane amplifikacją ludzkiego materiału genetycznego, a nie wirusowego? Czy stąd „tyle” wyników fałszywie dodatnich. Odpowiedź brzmi: „Nie. To teoria spiskowa i nieprawdziwa”. Faktycznie, w protokole WHO jest mowa o primerach nCoV_IP2-12759Rv CTCCCTTTGTTGTGTTGT, jednak cały szkopuł w tym, że to jest starter wsteczny (reverse primer), a nie ten, który jest identyczny z fragmentem powielanym (forward primer). W reakcji RT-PCR używa się zawsze dwóch rodzajów starterów: przednie (z ang. forward) i wsteczne (z ang. reverse). Pierwszy łączy się z nicią antysensowną i jest taki sam, jak sekwencja powielana (np. wirusowy materiał genetyczny), zaś drugi łączy się z nicią kodującą i jest do niej komplementarny (tworzy nić niekodującą, antysensowną).

Cały protokół tutaj:

https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/whoinhouseassays.pdf?sfvrsn=de3a76aa_2

Spójrzmy na genom wirusa SARS-CoV2:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045512.2?report=fasta

Nie znajdziemy w niej sekwencji CTCCCTTTGTTGTGTTGT, która byłaby powielana przy użyciu starterów „forward”. A co, gdybyśmy użyli startera (primera) reverse? Otrzymujemy sekwencję ACAACACAACAAAGGGAG, którą bez problemu znajdujemy w genomie SARS-CoV-2. Wniosek: użyta w starterach sekwencja nie jest powielanym fragmentem materiału genetycznego, ale tworzy nić antysensowną (jest komplementarna do powielanego fragmentu). Zresztą, pomijając naukowy wywód, gdyby było jak w tytule, praktycznie każdy test PCR na koronawirusa wychodziłby zawsze dodatnio, a jak wiemy, tak nie jest. W diagnostyce laboratoryjnej wykorzystuje się kontrolę wewnętrzną, dodatnią, ujemną i dla wzmocnienia czułości diagnostycznej metody, amplifikację 3 genów: E (niespecyficzny dla SARS-CoV-2) oraz RdRp, ORF1ab lub N (swoiste dla SARS-CoV2). Test jest prowadzony w odczycie real time, przy zastosowaniu sond znakowanych barwnikiem (np. HEX, FAM, Texas Red). Test wychodzi ujemny w zakażeniach niepandemicznymi koronawirusami. O możliwych przyczynach fałszywie dodanich wyników, mówiłem w innych filmach (Playlista Koronawirus SARS-CoV-2. COVID-19. Testy na koronawirusa). Tamże zamieściłem piśmiennictwo, z którego korzystałem również w przygotowaniach do tego filmu.